Jmol jest programem napisanym w Javie, tak więc jest programem wielosystemowym (Linux, Widmows, MacOS). Istnieje jako samodzielna aplikacja, a także jako aplet do umieszczenia na stronie WWW.
Możliwości programu:
- Otwiera pliki cząstek w formatach: CIF/mmCIF, CML, CSF, CTFile, GAMESS, Gaussian 94/98/03 output, Ghemical, HIN/HIV, Jaguar, MM1GP, MOL, MOLPRO, MOPAC 93/97/2002 output, NWCHEM, odydata, PDB, QOUT, SDF, SHELX, SMOL, spinput, xodydata, XYZ/XYZ+vib/XYZ-FAH.
- Ładnie renderuje cząstki :-)
- Pokazuje animacje i drgania (np. z plików .log Gaussiana)
- Potrafi mierzyć odległości i kąty między atomami
- Eksportuje pliki cząstek do formatów graficznych: .jpg, .png, .ppm, .pdf lub do formatu PovRay
- Posiada dużo opcji wizualizacyjnych: zmiana postaci wyświetlania atomów i wiązań (kulki, linie, sfery van der Waalsa, wstążki dla biomolekuł, różne kolorystyki), dodawanie boksu i osi, pokazywanie etykiet, rotacja, skalowanie, etc.
- Własny język skryptowy
- Wsparcie dla publikacji cząsteczek chemicznych na stronie WWW (nie korzystałem z tego)
Program jest dość ciekawy, chociaż długo się włącza (i dość długo ładuje cząsteczki).
Na koniec dwa obrazki:
![](https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEj0uocNHRsgl1pjdBZcAVv7-lwWLB2XIUXNXP4pNljjPFOQIhtZlaGWTjcmdtZ0PWP1UmhWSUxQMH5qisqvdJbogRei11RN5zkpnWZcxmraaNOCeHZlY1Iseq_altCQrrctbLKZsKTu6Hc/s320/jmol1.png)
![](https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEh6m5Pkcqbcs2M6Uy2vXZei_qXtMQbIcywHA51BVgoXIMHsdZYnsAoJlZrVUk68c_99gLrPdxHzIh4Np07LJHZJhXmY_nPdnQwEmPg1NfZrGKDYY5ApuSKXLGfVgLgoQZg75IpCnml71bk/s320/jmol2.png)
Strona domowa programu: http://jmol.sourceforge.net/
Strona wiki: http://wiki.jmol.org/index.php/Main_Page
Brak komentarzy:
Prześlij komentarz